Evaluación de la bioseguridad del protocolo de extracción de ADN para especies del complejo Mycobacterium tuberculosis implementado en el Instituto Nacional de Salud
Palabras clave:
Mycobacterium tuberculosis, exposición a agentes biológicos, ADN, técnicas y procedimientos de laboratorio.
Resumen
Introducción. El trabajo con Mycobacterium tuberculosis se considera un factor de riesgo para el personal de laboratorio que manipula especímenes clínicos y cultivos. Uno de los procesos que requiere de una alta concentración de microorganismos es la extracción de ADN para realizar metodologías moleculares. Se han reportado casos de tuberculosis pulmonar en profesionales que realizan procedimientos moleculares en los que se requiere previa manipulación del microorganismo en masa, lo cual ha motivado la investigación sobre la bioseguridad del protocolo de extracción, sin que a la fecha haya consenso sobre los riesgos del proceso.Objetivo. Evaluar la bioseguridad del protocolo de extracción de ADN reportado por van Soolingen et al., 2002, mediante la determinación de la viabilidad de M. tuberculosis en cada etapa del proceso.
Materiales y métodos. Se realizaron 880 cultivos a partir de 220 aislamientos clínicos de M. tuberculosis que se procesaron para las tres primeras fases de extracción de ADN. A los cultivos positivos se les realizó identificación molecular por PRA hsp65 y caracterización por spoligotyping.
Resultados. Se obtuvo crecimiento en uno de los procedimientos realizados. Por caracterización molecular, se determinó que no correspondió al aislamiento analizado originalmente, sino que fue producto de contaminación cruzada.
Conclusión. Se determinó que el protocolo de extracción de ADN descrito por van Soolingen et al. (2002) e implementado en el Instituto Nacional de Salud de Colombia, es seguro para el personal de laboratorio y el medio ambiente.
Descargas
Los datos de descargas todavía no están disponibles.
Referencias bibliográficas
1. World Health Organization. Global tuberculosis control: Surveillance, lanning, nancing. WHO Report 2008 (WHO/HTM/TB/2008.393). Geneva: World Health Organization; 2008.
2. Bentwich Z, Maartens G, Torten D, Lal A, Lal R. Concurrent infections and HIV pathogenesis. AIDS. 2000;14:2071-81.
3. World Health Organization. Guidelines for the program-matic management of drug-resistant tuberculosis. WHO/HTM/TB/2006.361. Geneva: World Health Organization; 2006.
4. Broekmans J. Control strategies and programme management. In: Porter JD, McAdam PW, editors. Tuberculosis, back to the future. New York, N.Y: John Wiley & Sons Inc.; 1994. p. 171-92.
5. Supply P, Mazars E, Lesjean S, Vincent V, Gicquel B, Locht C. Variable human minisatellite-like regions in the Mycobacterium tuberculosis genome. Mol Microbiol. 2000;36:762-71.
6. Devallois A, Goh K, Rastogi N. Rapid identification of mycobacteria to species level by PCR-restriction fragment length polymorphism analysis of the hsp65 gene and proposition of an algorithm to differentiate 34 myco-bacterial species. J Clin Microbiol. 1997;35:2969-73.
7. Van Embden J, Cave M, Crawford J, Dale J, Eisenach K, Gicquel B. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: Recommendations for a standardized methodology. J Clin Microbiol. 1993;31:406-9.
8. Kamerbeek J, Schouls L, Kolk A, van Agterveld M, van Soolingen D, Kuijper S, et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J Clin Microbiol. 1997;35:907-14.
9. Menzies D, Fanning A, Yuan L, Fitzgerald M. Tuberculosis among health care workers. N Engl J Med. 1995;332:92-8.
10. Bemer-Melchior P, Drugeon H. Inactivation of Mycobacterium tuberculosis for DNA typing analysis. J Clin Microbiol. 1999;37:2350-1.
11. Somerville W, Thibert L, Schwartzman K, Behr M. Extraction of Mycobacterium tuberculosis DNA: a question of containment. J Clin Microbiol. 2005;43:2996-7.
12. Van Soolingen D, Hermans P, de Haas P, Soll D, van Embden J. The occurrence and stability of insertion sequences in Mycobacterium tuberculosis complex strains: evaluation of an insertion sequence dependent DNA polymorphism as a tool in the epidemiology of tuberculosis. J Clin Microbiol. 1991;29:2578-86.
13. Van Soolingen D, de Hass P, Kremer K. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) typing of Mycobacteria. Bilthoven: National Institute of Public Health and the Environment; 2002.
14. Zwadyk P Jr, Down J, Myers N, Dey M. Rendering of mycobacteria safe for molecular diagnostic studies and development of a lysis method for strand displacement amplification and PCR. J Clin Microbiol. 1994;32:2140-6.
15. Collins C, Kennedy D. Laboratory-acquired infections: History, incidence, causes and prevention. 4th edition. Oxford: Butterworth-Heinemann; 1999.
16. Blackwood K, Burdz T, Turenne C, Sharma M, Kabani A, Wolfe J. Viability testing of material derived from Mycobacterium tuberculosis prior to removal from a containment level-III laboratory as a part of a laboratory risk assessment program. BMC Infect Dis. 2005;5:1-7.
17. Doig C, Seagar A, Watt B, Forbes K. The efficacy of the heat killing of Mycobacterium tuberculosis. J Clin Pathol. 2002;55:778-9.
18. Warren R, Kock M, Engelke E, Myburgh R, Van Pittius N, Victor T, et al. Safe Mycobacterium tuberculosis DNA extraction method that does not compromise integrity. J Clin Microbiol. 2006;44:254-6.
19. Djelouagji Z, Drancourt M. Inactivation of cultured Mycobacterium tuberculosis organisms prior to DNA extraction. J Clin Microbiol. 2006;44:1594-5.
20. Glynn J, Yates M, Crampin A. DNA fingerprint changes in tuberculosis: reinfection, evolution, or laboratory error? J Infect Dis. 2004;190:1158-66.
21. Small P, McClenny N, Singh S, Schoolnik G, Tompkins L, Mickelsen P. Molecular strain typing of Mycobacterium tuberculosis to confirm cross-contamination in the mycobacteriology laboratory and modification of procedures to minimize occurrence of false-positive cultures. J Clin Microbiol. 1993;31:1677-82.
22. Wurtz R, Demarais P, Trainor W. Specimen contamination in mycobacteriology laboratory detected by pseudo-outbreak of multidrug-resistant tuberculosis: analysis by routine epidemiology and confirmation by molecular technique. J Clin Microbiol. 1996;34:1017-9.
23. Burman W, Stone B, Reves R. The incidence of false-positive cultures for Mycobacterium tuberculosis. Am J Respir Crit Care Med. 1997;155:321-6.
24. Bhattacharya M, Dietrich S, Mosher L. Cross contamination of specimens with Mycobacterium tuberculosis: clinical significance, causes, and prevention. Am J Clin Pathol. 1998;109:324-30.
2. Bentwich Z, Maartens G, Torten D, Lal A, Lal R. Concurrent infections and HIV pathogenesis. AIDS. 2000;14:2071-81.
3. World Health Organization. Guidelines for the program-matic management of drug-resistant tuberculosis. WHO/HTM/TB/2006.361. Geneva: World Health Organization; 2006.
4. Broekmans J. Control strategies and programme management. In: Porter JD, McAdam PW, editors. Tuberculosis, back to the future. New York, N.Y: John Wiley & Sons Inc.; 1994. p. 171-92.
5. Supply P, Mazars E, Lesjean S, Vincent V, Gicquel B, Locht C. Variable human minisatellite-like regions in the Mycobacterium tuberculosis genome. Mol Microbiol. 2000;36:762-71.
6. Devallois A, Goh K, Rastogi N. Rapid identification of mycobacteria to species level by PCR-restriction fragment length polymorphism analysis of the hsp65 gene and proposition of an algorithm to differentiate 34 myco-bacterial species. J Clin Microbiol. 1997;35:2969-73.
7. Van Embden J, Cave M, Crawford J, Dale J, Eisenach K, Gicquel B. Strain identification of Mycobacterium tuberculosis by DNA fingerprinting: Recommendations for a standardized methodology. J Clin Microbiol. 1993;31:406-9.
8. Kamerbeek J, Schouls L, Kolk A, van Agterveld M, van Soolingen D, Kuijper S, et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J Clin Microbiol. 1997;35:907-14.
9. Menzies D, Fanning A, Yuan L, Fitzgerald M. Tuberculosis among health care workers. N Engl J Med. 1995;332:92-8.
10. Bemer-Melchior P, Drugeon H. Inactivation of Mycobacterium tuberculosis for DNA typing analysis. J Clin Microbiol. 1999;37:2350-1.
11. Somerville W, Thibert L, Schwartzman K, Behr M. Extraction of Mycobacterium tuberculosis DNA: a question of containment. J Clin Microbiol. 2005;43:2996-7.
12. Van Soolingen D, Hermans P, de Haas P, Soll D, van Embden J. The occurrence and stability of insertion sequences in Mycobacterium tuberculosis complex strains: evaluation of an insertion sequence dependent DNA polymorphism as a tool in the epidemiology of tuberculosis. J Clin Microbiol. 1991;29:2578-86.
13. Van Soolingen D, de Hass P, Kremer K. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) typing of Mycobacteria. Bilthoven: National Institute of Public Health and the Environment; 2002.
14. Zwadyk P Jr, Down J, Myers N, Dey M. Rendering of mycobacteria safe for molecular diagnostic studies and development of a lysis method for strand displacement amplification and PCR. J Clin Microbiol. 1994;32:2140-6.
15. Collins C, Kennedy D. Laboratory-acquired infections: History, incidence, causes and prevention. 4th edition. Oxford: Butterworth-Heinemann; 1999.
16. Blackwood K, Burdz T, Turenne C, Sharma M, Kabani A, Wolfe J. Viability testing of material derived from Mycobacterium tuberculosis prior to removal from a containment level-III laboratory as a part of a laboratory risk assessment program. BMC Infect Dis. 2005;5:1-7.
17. Doig C, Seagar A, Watt B, Forbes K. The efficacy of the heat killing of Mycobacterium tuberculosis. J Clin Pathol. 2002;55:778-9.
18. Warren R, Kock M, Engelke E, Myburgh R, Van Pittius N, Victor T, et al. Safe Mycobacterium tuberculosis DNA extraction method that does not compromise integrity. J Clin Microbiol. 2006;44:254-6.
19. Djelouagji Z, Drancourt M. Inactivation of cultured Mycobacterium tuberculosis organisms prior to DNA extraction. J Clin Microbiol. 2006;44:1594-5.
20. Glynn J, Yates M, Crampin A. DNA fingerprint changes in tuberculosis: reinfection, evolution, or laboratory error? J Infect Dis. 2004;190:1158-66.
21. Small P, McClenny N, Singh S, Schoolnik G, Tompkins L, Mickelsen P. Molecular strain typing of Mycobacterium tuberculosis to confirm cross-contamination in the mycobacteriology laboratory and modification of procedures to minimize occurrence of false-positive cultures. J Clin Microbiol. 1993;31:1677-82.
22. Wurtz R, Demarais P, Trainor W. Specimen contamination in mycobacteriology laboratory detected by pseudo-outbreak of multidrug-resistant tuberculosis: analysis by routine epidemiology and confirmation by molecular technique. J Clin Microbiol. 1996;34:1017-9.
23. Burman W, Stone B, Reves R. The incidence of false-positive cultures for Mycobacterium tuberculosis. Am J Respir Crit Care Med. 1997;155:321-6.
24. Bhattacharya M, Dietrich S, Mosher L. Cross contamination of specimens with Mycobacterium tuberculosis: clinical significance, causes, and prevention. Am J Clin Pathol. 1998;109:324-30.
Cómo citar
1.
Ribón W, Castro C, González L, Rozo JC, Puerto G. Evaluación de la bioseguridad del protocolo de extracción de ADN para especies del complejo Mycobacterium tuberculosis implementado en el Instituto Nacional de Salud. Biomed. [Internet]. 1 de diciembre de 2009 [citado 4 de abril de 2025];29(4):561-6. Disponible en: https://revistabiomedicaorg.biteca.online/index.php/biomedica/article/view/133
Algunos artículos similares:
- Juan Gabriel Bueno-Sánchez, Jairo René Martínez-Morales, Elena E. Stashenko, Wellman Ribón, Actividad antituberculosa de plantas colombianas , Biomédica: Vol. 29 Núm. 1 (2009)
- María Consuelo Garzón, Dailyn Yorledy Angée, Claudia Llerena, Dora Leticia Orjuela, Jorge Ernesto Victoria, Vigilancia de la resistencia del Mycobacterium tuberculosis a los fármacos antituberculosos, Colombia 2004-2005 , Biomédica: Vol. 28 Núm. 3 (2008)
- Diego Chaves, Andrea Sandoval, Luis Rodríguez, Juan C. García, Silvia Restrepo, María Mercedes Zambrano, Análisis comparativo de seis genomas del complejo Mycobacterium tuberculosis , Biomédica: Vol. 30 Núm. 1 (2010)
- María Imaz, Sonia Allassia, Mónica Aranibar, Alba Gunia, Susana Poggi, Ana Togneri, Lidia Wolff, Group of Implementation of Fluorescence, Rendimiento de la microscopía de fluorescencia LED para la detección de bacilos ácido-alcohol resistentes en muestras respiratorias en laboratorios periféricos de Argentina , Biomédica: Vol. 37 Núm. 2 (2017)
- Diana Castaño, Mauricio Rojas, Alteraciones en el reclutamiento y activación de proteínas Rab durante la infección micobacteriana , Biomédica: Vol. 30 Núm. 2 (2010)
- Adriana Rojas-Villarraga, Carlos Andrés Agudelo, Ricardo Pineda-Tamayo, Alvaro Porras, Gustavo Matute, Juan Manuel Anaya, Tuberculosis en pacientes tratados con antagonistas del factor de necrosis tumoral alfa en un área endémica, ¿vale la pena el riesgo? , Biomédica: Vol. 27 Núm. 2 (2007)
- Carlos A. Torres-Duque, Claudia Díaz, Leslie Vargas, Elsa María Serpa, Walter Mosquera, María Consuelo Garzón, Graciela Mejía, Luz Mary García, Liliana Andrea González, Claudia Marcela Castro, Wellman Ribón, Micobacteriosis diseminada con compromiso de válvula aórtica protésica: primer caso de Mycobacterium peregrinum de tipo III reportada en Colombia , Biomédica: Vol. 30 Núm. 3 (2010)
- Francisco Cuervo, Luis F. Giraldo, Alirio Bastidas, Carlos Vélez, Maria R. Forero, Fibrinógeno-trombina como tratamiento puente en un caso de hemoptisis masiva , Biomédica: Vol. 33 Núm. 1 (2013)
- Alvaro Javier ldrovo, Notas sobre el inicio de la epidemia de tuberculosis pulmonar en Bogotá (1870-1920) , Biomédica: Vol. 21 Núm. 3 (2001)
- Ivohne Fernanda Corrales, Jorge Alberto Cortés, María Lucía Mesa, Graciela Zamora, Osteomielitis esternal y escrofuloderma por vacuna BCG. , Biomédica: Vol. 23 Núm. 2 (2003)
Publicado
2009-12-01
Número
Sección
Artículos originales
Estadísticas de artículo | |
---|---|
Vistas de resúmenes | |
Vistas de PDF | |
Descargas de PDF | |
Vistas de HTML | |
Otras vistas |